As bactérias anaeróbicas são definidas como microorganismos capazes de sobreviver e multiplicar-se na ausência de oxigênio. Portanto, devemos tomar cuidado com o tipo de material que será coletado e o transporte até o laboratório, a fim de que o exame possa ser realizado dentro dos critérios adequados.

A amostra deve ser coletada preferencialmente antes do uso de antibióticos ou, estando o paciente na sua vigência, comunicar ao laboratório.

Um aspecto importante para uma boa rotina anaeróbica é cultivar apenas aqueles materiais que foram coletados e transportados apropriadamente.

A amostra ideal é aquela colhida por meio de aspirado com agulha e seringa ou fragmento do tecido infectado, evitando a contaminação com microbiota endógena.

As amostras deverão ser transportadas e armazenadas à temperatura ambiente. O armazenamento em estufa bacteriológica ocasionará o desenvolvimento rápido das bactérias facultativas. Já a refrigeração aumentará a difusão do oxigênio, ocasionando perda de algumas bactérias anaeróbicas presentes no material.

Tipos de tubos e meios para transporte de anaeróbicos:
•  Swab com meio de transporte Amies com carvão – contendo atmosfera adequada para o transporte de anaeróbicos;
•  Frasco de hemocultura para anaeróbicos;
•  Frascos com meios líquidos para transporte – livre de oxigênio;
•  Seringa vedada – evitar, sempre que possível, o transporte com agulha devido ao risco de acidentes.

A coleta de swab comum não é recomendada pelas seguintes razões:
•  O material pode ser facilmente contaminado com organismos de pele ou superfície mucosa;
•  Os anaeróbicos ficam expostos ao oxigênio;
•  A quantidade de material é relativamente pequena e poderá ressecar facilmente.

Amostras aceitáveis

•  Líquidos orgânicos de sítios anatômicos normalmente estéreis;
•  Sangue;
•  Medula óssea;
•  Biópsia e fragmento de tecido;
•  Fragmento ósseo;
•  Secreção aspirada após descontaminação da pele;
•  Material coletado por meio de broncoscopia com cateter protegido;
•  Urina colhida por punção suprapúbica;
•  Aspirado profundo de ferida aberta obtido por meio de procedimento cirúrgico (quando não for possível obter aspirado do material). Utilizar sistema de transporte apropriado para anaeróbicos, livre de oxigênio;
•  Material de laparoscopia, aspirado, após descontaminação, material de biópsia obtido cirurgicamente.

Amostras inaceitáveis

•  Swab de orofaringe, nasofaringe e gengiva;
•  Material de ferida superficial de pele coletado com swab ou bordas da ferida;
•  Escarro aspirado endotraqueal, material de broncoscopia não coletado com cateter protegido;
•  Urina coletada espontaneamente ou por meio de cateter;
•  Swab otológico, vaginal e uretral.

Transporte

As amostras biológicas devem ser transportadas rapidamente ao laboratório, em geral 1 a 2 horas após a coleta. Pequenos volumes de material (em torno de 1ml) deverão ser transportados ao laboratório em até 30min.